1、大雄宝殿

大雄宝殿是寺庙的主殿，或称大殿，也是寺内僧人上早、晚课的场所。

2、藏经阁

藏经阁是北院的主体建筑，是收藏佛教经典和艺术珍品的地方。

3、罗汉堂

罗汉堂布局成“田”字型格局，安放了五百多尊塑像。

4、新山门

归元寺的外山门为新山门，采用仿古风格设计而成。外山门的扇门为仿古式朱红殿门，为三开门式，中间为一大拱门，左右各有一小拱门。

5、山门

山门为古典式的八字门形式建筑，朝阳而开，象征吉祥。归元禅寺山门前的石狮，连座共高2.3米，原镇守在汉阳县衙、府衙门前，是明代遗物。

6、昌明长老纪念塔

昌明长老纪念塔也称塔院。这里介绍昌明长老生平，展出昌明长老的遗物、书法等。另设有接待信众做法事场所及往生堂。

7、归元正藏图书馆

归元正藏图书馆为全国首家由寺院完全发起、信众共建、配套设施相对齐全、并向社会开放的现代化佛教主题图书馆。

8、云集斋

云集斋前身系民国年间重建之南云水寮房，斋内的素菜特点是清淡、咸鲜，品种已有二百来种。

9、财宝天王殿

财宝天王殿内供奉五尊铸铜像，主奉财宝天王，每尊重约3吨。

10、圆通阁

“圆通”一词来源于佛典中的“圆通菩萨”该建筑于2009年上半年破土动工，是由宫殿式石台座和红木榫卯结构组合而成，其风格为内五层外三层四滴水楼阁式建筑，是中国大型传统木结构建筑之一。

11、钟鼓楼

归元钟楼之钟，上铸“归元禅寺幽冥钟”，自铸造到现在近半个世纪，记载了武汉劳动人民手工技术、智慧和合作精神。

12、放生池

放生池之设，体现佛陀之慈悲戒杀精神。放生池宽15.6米，长25米，由64根石柱和64块石刻板组成楼栏杆，每根石柱上雕刻一尊石狮。

13、观音阁双面观音

观音菩萨为双面造型，黄铜铸造，周围是汉白玉栏杆，像高18.8米，立于一个3米高的莲台之上，重达20吨，双面观音为二臂正观音基本形，也称为圣观音像。

14、韦驮殿

韦驮殿门前的石狮为百年文物，出自清代匠人之手。大门上的匾额“归元古刹”为黎元洪的手书。

15、三圣殿

三圣殿以前是寺内僧人打坐念经的地方，主要供奉着“西方三圣”，三尊佛像均是采用高约4米、直径约1.5米的樟木雕刻而成。供桌前帘幕栏有四组唐玄奘西天取经故事的镂空浮雕群像。